Flora Nadgoplańskiego Parku Tysiąclecia liczy 865 gatunków roślin

 naczyniowych co stanowi około 50% całej flory naczyniowej Polski.

 Wskutek zabiegów melioracyjnych nastąpiło obniżenie poziomu wód

 gruntowych, co w konsekwencji doprowadziło do spadku liczby

 gatunków hydrofilnych- torfowiskowo bagiennych i łąkowych. Dodatkowo

 pojawiły się gatunki antropogeniczne związane z działalnością człowieka.

 Roślinność wodna reprezentowana jest przede wszystkim przez wywłócznika, grążela białego oraz grzybienia białego, które spotykamy  w zatokach i wokół wysp. Roślinność nadbrzeżna jest na terenie parku bardzo pospolita, reprezentowana jest przez pas trzcin i oczerertów,  w których dominuje trzcina pospolita i pałka wąskolistna obok tych dominujących roślin  występuje oczeret, skrzyp bagienny i jeżogłówka gałęzista.

 Roślinność łąk i pastwisk to przede wszystkim zespoły traw i turzyc.

 Dominującym typem łąk są łąki wilgotne i świeże. Zbiorowiska leśne

 ograniczone są do nielicznych płatów. Największy kompleks leśny występuje

 w okolicach Lubstówka.   Nad brzegami jezior obserwujemy łęgi jesionowo-olszowe,

 wierzbowo-topolowe, jesionowo- wiązowe

 Na terenie parku pewną osobliwością są  rośliny kserotermiczne ,czyli ciepłolubne

 występują na nasłonecznionych zboczach o wystawie południowej. W okolicach

 Mietlicy występuje ślazówka turyngska, w okolicach Kruszwicy, Gocanowa i Mietlicy rośnie czyściec         wyprostowany, jak również dziewanna fioletowa. W okolicach Gopła spotkać można również halofity czyli rośliny słonolubne np. mlecznika nadmorskiego, muchotrzewa solniskowego oraz świbkę morską.

Na terenie parku odnotowano

11 gat. wymierających w Wielkopolsce i na Kujawach,

50 gat. zagrożonych wymarciem,

12 gat. rzadkich,

9 gat. częściowo chronionych w Polsce,

21 gat. objętych ochroną całkowitą w Polsce.

Gatunki o najwyższych walorach florystycznych

stanowi grupa złożona z 158 gatunków.

Gatunków najsilniej zagrożonych wymarciem na terenie NPT jest 99.

Gatunków,  które decydują o swoistości flory Nadgopla jest 103

gatunków specjalnej troski jest 57